Plusieurs années dans le futur, la technologie s'est développée au point où les enfants (et les plus grands) peuvent créer et personnaliser des poupées pour les faire combattre grâce à  la télépathie. Au même moment, Misaki SUZUHARA, qui va entrer en classe de quatrième, vient habiter à  Tokyo, ville où se déroule la plupart des combats. Elle est témoin d'une rencontre d'Angelic Layer sur un grand écran de la gare. Misaki est fascinée par le combat qui oppose deux "poupées", des Anges, car la plus petite des deux gagne le combat. Elle décide d'en acheter une sur le champ, aidée par Icchan. Elle va fabriquer son propre Ange qu'elle baptisera Hikaru ....