Un homme est traqué par une unité d'élite prête à  tout pour récupèrer la précieuse malette qu'il a dérobée. Celle-ci contient trois unités Guyver, des armes redoutables et entourées d'un grand mystère. Sho est un jeune étudiant étourdit et amoureux. Alors qu'il rentre chez lui, il est témoin d'un évènement singulier qui va le projeter malgré lui au coeur d'une tumulteuse et éprouvante épopée ...