 Pendant que le mystérieux kidnappeurs pénètre chez Michael pour voler une photo de Laurie Duprée, Michael et Maria entre chez les Duprée pour y trouver une Laurie effrayée et instable. Lorsqu'ils sont découverts par l'oncle et la tante de Laurie, ils sont chassés.
Pendant ce temps, le Shérif Valenti et l'agent Duff arrêtent Grant Sorenson et lui montrent un mandat pour fouiller sa voiture. Lorsque Grant est incapable de justifier une paire de gants et des égratignures sur son cou, il se défend en racontant à  Duff que Valenti l'avait persécuté depuis le jour.
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Maria et Michael vont au cadastre et y découvrent que Laurie est la véritable propriétaire de la maison Duprée. Ils retournent chez les Duprée, où ils sont invités à  rester. Maria révèle à  Meredith Duprée qu'elle sait que la famille a payé le médecin pour que Laurie soit déclarée folle et pour qu'ils puissent récupérer toute la fortune. Dans un abri anti-atomique, sous la maison, Laurie parle de son grand père à  Michael. Elle lui montre les vieux carnets que son grand père avait l'habitude d'utiliser pour raconter comment il avait été enlevé et comment cela l'avait rendu fou. Michael se rend compte que Laurie et son grand père ont la déficience génétique dont les gandariens ont besoin pour survivre. Il lui avoue qu'elle n'est pas folle et que ce qui lui est arrivé est réel. Il lui dit qu'elle a raison de vouloir récupérer ce qui lui appartient, y compris sa vie et la maison.
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Au Crashdown, Max, Liz, Tess et Isabel se retrouvent pour parler de ce que Larek a dit des gandariens. Brody apparaît en tant que Larek et explique que les gandariens sont une forme de vie génétiquement modifiée, faisant d'habitude un lien entre l'ADN humain et l'ADN extraterrestre, dans le but de créer des hybrides. Il va jusqu'à  dire qu'ils infecteront seulement des humains ayant une déficience qu'ils peuvent utiliser ; et, dans ce cas, Laurie Duprée et les humains infectés mourront. Tess et Liz se rendent compte que les gandariens n'ont pas terminé ce qu'ils avaient commencé avec Laurie ; c'est pour cela qu'ils sont encore après elle.
Larek explique qu'il y a une reine et une ruche, et que s'ils peuvent la tuer, les autres gandariens mourront. Max donne rendez-vous à  tout le monde à  Frazier Woods pour retrouver le nid de cristaux.
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A Frazier Woods, alors que Kyle et Alex font des recherches, ils découvrent une grotte contenant la ruche et se retrouvent piégés à  l'intérieur. Kyle téléphone à  Liz pour lui dire où ils sont et lui expliquer qu'ils ne peuvent pas sortir. Max, Isabel et Tess tentent d'utiliser leurs pouvoirs pour pénétrer dans la grotte mais ils sont inefficaces. Isabel va chercher des outils pour faire sortir Kyle et Alex pendant que Max, Tess et Liz essayent de les tirer de là . Dans la grotte,, Alex et Kyle découvrent que les gandariens sont morts, par manque d'oxygène.
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A l'UFO Center, Isabel est droguée et kidnappée par Grant. Plus tard, en se réveillant, elle le découvre en train de raconter qu'il ne se souvient de rien de ce qui lui est arrivé et lui demande de l'aide. Isabel se rend compte que Grant a été infecté par les gandariens lorsqu'il avait fait des fouilles à  Puhlman Ranch, au dessus de la rivière, et en conclut que la reine doit être dans son corps. Grant raconte à  Isabel qu'il était sensé la tuer mais n'aurait pas pu se résoudre à  le faire. Il la fait sortir de la voiture et elle téléphone à  Valenti pour lui dire d'aller chez les Duprée pour empêcher Grant de tuer Laurie. Valenti va retrouver l'agent Duff, lui explique la situation et lui demande de l'accompagner à  Tucson.
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Chez les Duprée, au bord de la piscine, Michael téléphone à  Max qui lui explique qu'ils ont appris que les gandariens avaient besoin d'oxygène pour survivre. Se sentant en sécurité, Maria, Laurie et Michael profitent d'un excellent dîner. Sur les conseils de Maria, Michael part à  la recherche de la bonne et découvre qu'elle a été tuée. Il dit à  Maria d'emmener Laurie dans un endroit sûr et part à  la recherche de l'intrus. Pendant que Maria et Laurie se glissent dans l'abri anti-atomique, Michael est abattu par Grant.
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Grant se jette sur Laurie, juste au moment où Valenti et Duff arrivent à  la maison et trouvent Michael sur le sol. Il leur dit de poursuivre Grant, qui a prit Laurie en otage. Duff abat Grant et chacun peut voir la reine des gandariens sortir de son corps. Se souvenant de ce que Max lui avait dit, Michael se rapproche de la reine et utilise ses pouvoirs pour priver la pièce d'oxygène. La reine, enfin morte, ils détruisent la ruche et libèrent Kyle et Alex.
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Ne sachant pas trop ce qu'elle a vu, Valenti explique à  Duff que parfois, il vaut mieux les choses inexpliquées, surtout si elle veut préserver sa carrière.
Michael dit au revoir à  une Laurie, maintenant en sécurité.