Chidori Kaname est capturée par l'ennemi, lequel conduit sur elle des expériences scientifiques afin de lui extraire les secrets de la Black Technology. Malgré ses consignes formelles de sauver en priorité les passagers de l'avion retenus en otage par les terroristes, Sousuke Sagara décide d'enfreindre les ordres et vient en aide à  Chidori. Pendant ce temps, l'organisation Mithril déploie ses forces pour secourir les otages.