L'utilisation des Sleepers contre l'envahisseur, pour la présence de cellules B dans leur organisme, s'est donc retourné contre ceux même qui avaient planifié cette stratégie. Tony et Alicia, accompagnés par une armée de Blues, ont pris le commandement de la station médicale sous l'emprise du pouvoir destructeur contenu par ces cellules. Ils veulent en effet écraser la navette sur Second Earth afin d'éradiquer les derniers vestiges de l'humanité. Sur un fond de mutinerie, de nouvelles autorités se sont mises en place et ont envoyé des vaisseaux sur la station médicale pour s'y infiltrer et éviter la catastrophe. Yûji et Marlène, après avoir difficilement quitté la Terre, décident aux aussi de se rendre sur le front afin d'essayer de raisonner Tony.