Warius Zero se retrouve muté sur un vaisseau de seconde classe et est à  deux doigts d'en quitter le commandement quand il croise un pirate de l'espace, un certain Captain Harlock. L'éradication des pirates de l'espace est une des clés de la fragile entente entre humains et humanoïdes. Aussi, il relève le défi de l'affronter...