Depuis la destruction du Nostromo, Ripley dérive dans l'espace. Elle est recueillie au bout de 50 ans. On lui apprend que la planète des Aliens est occupée par des colons. Un commando y est envoyé, dont elle est la conseillère. Sur Acheron, toute vie a disparu. Ils sont attaqués par une cohorte d'aliens qui détruisent leur navette...